Soubor s chemickými informacemi vytvořený podle ChemDraw, molekuly úpravy programu sady pro platformy Macintosh a Windows, ukládá molekulární data v tagovaném binárním formátu, slouží k ukládání přesných chemických výkresy. CDX soubory ukládat informace, jako jsou atomy, vazby, fragmenty, šipek a textu.
Formát CDX je nativní formát používaný ChemDraw. Další formát nazvaný CDXML (.CDXML soubory) se používá pro export a výměnu CDX dat ve formátu XML.